Увесь населений пункт міста зник — без жодного сліду. Юкі, єдина, хто вижив, приєднується до Такуї, кур’єра за контрактом, у небезпечній подорожі на пошуки відповідей у новозваному місті-примарі «Лост». Єдиною підказкою для них стає лист від батька Юкі, тоді як загадкова організація робить усе, щоб зупинити їхні розслідування.