Кришталеві небеса минулого розповідають історію звичайного підлітка Сяоі Ту, який живе в прибережному китайському містечку у кінці 90-х років. Цей хлопець не надто переймається успішністю в школі, натомість віддає перевагу відеоіграми й проводженню часу з другом на прізвисько "Арахіс". Життя Сяоі починає мінятися після того, як вчитель обирає його разом із чарівною дівчиною Чжетянь Яо на посаду старост класу.
Новий статус і близькість до Яо змушують Сяоі вперше відчути справжні почуття закоханості. Він прагне стати кращим, щоб справити враження на однокласницю і водночас пізнати уроки дружби, розчарувань і перших любовних переживань. Ця історія ніжного підліткового зростання наповнена теплом і ностальгією за безтурботними шкільними роками.
