Події «Імперії трупів» розгортаються у Європі XIX століття і зосереджені навколо Джона Вотсона. Його вербують до таємної урядової служби як секретного агента. Однак Вотсон живе у світі, де «Франкенштейни» — людські тіла, оживлені штучною душею для виконання важкої праці — використовуються для прискорення промислового розвитку.