Кента, покемон-тренер, який лише починає свій шлях, зустрічається зі своєю дитячою подругою Маріною в Покемон-Центрі, щоб перевірити, як розвинулись їхні навички. Їхній поєдинок перериває грозна злива і появу Башо та Бусона, двох членів Рокетто-Дану, які використовують Кристал-систему — пристрій, що приваблює покемонів електричного типу. Під керівництвом Шірануї-хакасе вони мають на меті повернути покемонів до Сакакі. Кента і Маріна випадково дізнаються про цей план і намагаються його зупинити, але ситуація ускладнюється, коли легендарного покемона Райко захоплюють.